Обнаружена лекарственная устойчивость при болезни Крона

Болезнь Крона
                Микрофотография болезни Крона с большим увеличением. Биопсия пищевода. H & E пятно. Предоставлено: Nephron/Wikipedia.

Путем картирования более 100 000 иммунных клеток у пациентов с болезнью Крона исследователи Mount Sinai обнаружили сигнатуру клеток, которые участвуют в типе заболевания, которое не поддается лечению, согласно исследованию, опубликованному в Клетка в августе. Открытие открывает двери для определения биомаркеров и индивидуального выбора вариантов лечения для пациентов.
                                                                                       

В исследовании были проанализированы образцы биопсии воспаленных и не воспаленных поражений болезнью Крона на ткани тонкой кишки, как только она была удалена у пациентов. Исследователи использовали секвенирование одноклеточной РНК и технологию CyTOF для изучения поражений кишечника в режиме реального времени на одноклеточном уровне, выявления иммунных клеток и циркулирующих клеток крови и их взаимодействия внутри и вокруг поражения, а также для картирования ландшафта тысяч клеток. клетки в очаге поражения.

В результате анализа была обнаружена сигнатура точных типов клеток, ранее не идентифицированных, которая коррелирует с устойчивостью пациента к стандартной терапии по болезни Крона, противовоспалительному препарату, называемому ингибитором ФНО. Ингибитор ФНО является основным средством, назначаемым пациентам с болезнью Крона средней и тяжелой степени, но около 40 процентов пациентов, принимающих ингибитор, в конечном итоге либо не реагируют на него, либо ухудшают состояние Крона.

«Профилирование отдельных клеток может трансформировать открытие лекарств», — говорит со-корреспондент Мириам Мерад, доктор медицинских наук, директор Института точной иммунологии Медицинского факультета Икан на горе Синай, профессор Синайской горы в Раке. Иммунология, Со-директор программы иммунологии рака в Институте рака Тиша и директор Центра мониторинга иммунитета человека на горе Синай. «Это действительно даст нам гораздо больше ясности в отношении воспалительного заболевания кишечника и того, почему пациенты сопротивляются и на что еще мы могли бы ориентироваться».

Наличие подписи для идентификации пациентов, которые не смогут применять ингибитор, помогает избежать хирургического вмешательства и осложнений. Основываясь на результатах этого исследования, исследователи уже разработали клиническое исследование, которое проверит, можно ли найти сигнатуру в анализе крови, когда у пациента диагностировано воспалительное заболевание кишечника. В этом случае врачи могут избегать использования ингибитора ФНО и использовать другие биопрепараты, которые будут работать для этого пациента.

«Мы разработали это исследование таким образом, чтобы определить воспаление с беспрецедентной точностью, используя иммунологию и вычислительную биологию, чтобы лучше понять эту болезнь», — сказала соавтор журнала Джуди Х. Чо, доктор медицинских наук, старший помощник декана по точной медицине. Директор Института персонализированной медицины им. Чарльза Бронфмана, профессор трансляционной генетики Уорд-Колман и профессор медицины, генетики и геномики в Медицинской школе Икан. «Эти результаты подчеркивают ограничения современных диагностических анализов и потенциал инструментов для картирования отдельных клеток для выявления новых биомаркеров для ответа на лечение и индивидуальных терапевтических возможностей».

В этом исследовании рассматривались четыре группы пациентов и использовался одноклеточный анализ одной группы для идентификации сигнатуры. Затем исследователи накладывали данные одноклеточного анализа на множество больших наборов данных, состоящих из трех других групп пациентов, ткани которых были проанализированы и чьи результаты с ингибитором ФНО были известны. Используя алгоритм и вычислительную биологию, исследователи подтвердили, что сигнатура, идентифицированная по одноэлементной последовательности, дает несколько независимых групп с известными результатами лечения.

«Наше исследование показывает, что подходы, которые сочетают одноклеточное картирование воспалительных очагов с высоким разрешением у небольшого числа пациентов с секвенированием РНК в больших когортах с обширной клинической характеристикой, приводят к обобщенным выводам, подчеркивая потенциал для широкой трансформации понимания человеческие многофакторные иммуноопосредованные воспалительные заболевания «, — сказал соавтор Ephraim Kenigsberg, Ph.D., доцент кафедры генетики и геномных наук в Институте наук о данных и геномной технологии Icahn. Первый автор Джером К. Мартин, PharmD, Ph.D., научный сотрудник Института прецизионной иммунологии в Медицинской школе Икан на горе Синай, также сыграл важную роль в этом исследовании.

Поделится с друзьями

Добавить комментарий

Ваш e-mail не будет опубликован. Обязательные поля помечены *