Профилирование микробиома выявляет ассоциации с тяжестью язвенного колита, лечение

Профилирование микробиома выявляет ассоциации с тяжестью язвенного колита, лечением
                Предоставлено: Сюзанна М. Гамильтон, Broad Communications.

Исследование кишечных микробов более чем у 400 детей показывает, как микробиом ведет себя при этом воспалительном заболевании кишечника.
                                                                                       

Желудочно-кишечный тракт содержит сложный набор взаимоотношений, включающий различные клетки-хозяева (например, эпителиальные клетки, иммунные клетки) и множество микробов, которые попадают в кишечник (в совокупности известный как кишечный микробиом). При язвенном колите (ЯК) и болезни Крона эти взаимосвязи прерываются механизмами, которые исследователи еще не полностью осознают, но в которых микробиом может играть решающую роль.

Чтобы лучше понять, где микробы подходят для развития и лечения ЯК, многоцентровая команда во главе с ученым-вычислительнщиком Мелани Ширмер и главным сотрудником института Рамником Ксавье из Программы по инфекционным болезням и микробиомам Броада (IDMP) представила микробиомы кишечника 405 детей с ЯК. в течение года после постановки диагноза.

Путем объединения полных медицинских записей вместе с 16-секвенированием рРНК-ампликонов — методом секвенирования, который дает снимок всех микробов в образце — биопсии стула и кишечника пациента, команда обнаружила четкие закономерности в составе микробиома, которые отслеживаются с течением времени при заболевании. тяжесть и ответ лечения. Они сообщили о своих находках в Cell Host & Microbe.

«Большая часть работы по профилированию микробиома, связанной с язвенным колитом, была сосредоточена на лечении пациентов», — сказал Ксавье, который руководит как IDMP, так и Центром микробиомной информатики и терапии (CMIT) при Массачусетском технологическом институте. Он также руководит Центром вычислительной и интегральной биологии при Массачусетской больнице общего профиля. «Это исследование помогло выявить особенности наивного для лечения микробиома в педиатрическом ЯК и выявить связи между микробиомом и рефрактерным заболеванием».

В целом, исследователи связывают численность 50 микроорганизмов с серьезностью заболевания при постановке диагноза. Они также обнаружили, что изменения в численности микробов с течением времени связаны с тем, реагирует ли болезнь ребенка на стандартную терапию. Это включало удивительное открытие, что микробиомы от детей с тяжелым ЯК были необычно богаты бактериями, обычно находящимися во рту, которые усиливают воспаление у пациентов с ЯК.

Команда также отметила, что уровни определенных антител, направленных против микроорганизмов, изменились у пациентов с ЯК. Эти изменения также отслеживаются по степени тяжести заболевания и позволяют предположить, что взаимодействие между иммунной системой и некоторыми кишечными микробами может влиять на то, ухудшается ли болезнь ребенка или улучшается со временем.

Авторы указали, что они не могут сказать, помогают ли обнаруженные ими шаблоны вызвать UC. Тем не менее, их результаты показывают, что микробиомы могут служить терапевтическими ресурсами для лечения ЯК, биомаркерами для прогнозирования клинического течения пациента, а также для планирования и мониторинга помощи.

Группа Ширмера и Ксавье провела свой анализ под эгидой PROTECT, исследования, проводимого при поддержке Национального института здравоохранения и направленного на то, чтобы лучше понять, как дети, у которых недавно был диагностирован ЯК, реагируют на стандартные начальные методы лечения ./p>

Поделится с друзьями

Добавить комментарий

Ваш e-mail не будет опубликован. Обязательные поля помечены *