Комплексное изучение генетических рисков воспалительных заболеваний кишечника у афроамериканцев

Исследователи из Медицинской школы Университета Джона Хопкинса вместе с коллегами из Университета Эмори и Седарс-Синай опубликовали в журнале Gastroenterology первый крупный, углубленный анализ генетических факторов риска воспалительные заболевания кишечника у афроамериканцев.
                                                                                       

Исследование «Характеристика генетических локусов, влияющих на восприимчивость к воспалительным заболеваниям кишечника у афроамериканцев», представляет собой интенсивную оценку генетики воспалительных заболеваний кишечника (ВЗК) в афро-американской популяции.

Болезнь Крона и язвенный колит — это хронические аутоиммунные заболевания, от которых страдают 1,6 миллиона американцев. Пациенты с ВЗК имеют иммунную систему, которая атакует их собственный кишечник, что приводит к воспалению. По данным Американского фонда Крона и Колита, в последние годы отмечается неуклонный рост числа случаев ВЗК среди афроамериканцев.

«Это исследование стало кульминацией более чем десятилетней работы», — говорит Стивен Брант, доктор медицинских наук, директор Центра воспалительных заболеваний кишечника имени Джона Хопкинса Мейерхоффа и соответствующий автор исследования. «Мы надеемся, что это первый из многих шагов для лучшего понимания и лечения этих изнурительных заболеваний».

Генетика IBD была оценена в более чем 1000 исследованиях среди белых и азиатских — в основном восточноазиатских — популяций. Хотя риск немного ниже, чем у белых американцев, афроамериканцы подвергаются значительному риску ВЗК.

В ходе исследования были оценены более 1500 афроамериканских пациентов с ВЗК, в том числе 1088 с болезнью Крона и 361 с язвенным колитом, из 35 центров ВЗК в Северной Америке и 177 афроамериканцев без ВЗК для сравнения.

«Очевидно, что есть различия с проявлениями болезни с ВЗК у афроамериканцев», — говорит Субра Кугатасан, доктор медицины, из Медицинской школы Университета Эмори и старший автор исследования. «Мы надеемся получить генетическое объяснение этому путем расширения исследований на афро-американцах».

Основная цель исследования состояла в том, чтобы определить, имеют ли афроамериканцы те же 163 отдельные генетические вариации, установленные у белых американцев, что и генетические факторы риска ВЗК. Вторичной целью было выявление новых областей генома, известных как локусы, вызывающих риск ВЗК у афро-американцев.

Исследователи также исследовали, существуют ли в большинстве этих генетических локусов ВЗК генетические вариации, представляющие особый риск возникновения ВЗК у афроамериканцев, отличные от тех, которые выявляются у белых.

«Мы также изучили, существуют ли области генома, которые вызывают или защищают риск IBD у афроамериканцев, которые происходят от их западноафриканских или европейских генетических предков», — говорит Брант.

Исследователи обнаружили, что варианты генов в трех наиболее ассоциированных областях для болезни Крона у белых — NOD2, рецептор интерлейкина 23 (IL23R) и область на хромосоме 5, известная как 5p15.1 — также являются важными факторами риска для болезни Крона у афроамериканцев.

«Надежда на генетический прогресс заключается в том, что мы сможем разработать новые методы лечения и более персонализированные подходы к лечению этих хронических и потенциально изнурительных заболеваний», — говорит Дермот Макговерн, доктор медицинских наук, из Медицинского центра Cedars-Sinai и соавтор с Брантом и Кугатасаном. «Эти преимущества должны быть доступны для всех слоев общества. Это исследование важно, поскольку оно распространяет эти возможные достижения на афро-американское население, которое может подвергаться риску более тяжелого ВЗК».

Исследование показало, что у афроамериканцев, как и у белых и азиатов, доминирующим регионом генетического риска язвенного колита в регионе является лейкоцитарный антиген человека (HLA), регион, который является основным фактором, определяющим иммунную регуляцию и риски для другие иммунные заболевания, такие как целиакия и диабет 1 типа. Тем не менее, конкретный вариант, связанный с афро-американцами в этом регионе, такой же, как вариант, наиболее сильно связанный с язвенным колитом в Японии и Корее, и в меньшей степени язвенный колит у европейцев. Это также тот же вариант основного риска при HLA для волчанки у афроамериканцев, чей риск волчанки в четыре раза больше, чем у белых американцев.

В ходе исследования не было обнаружено доказательств того, что основной вариант риска для европейского язвенного колита играет определенную роль в афро-американской популяции. Авторы нашли убедительные, но не подтверждающие доказательства новых вариаций для основного гена IBD, субъединицы цитокина интерлейкина (IL) 12, IL12B, и для новых областей — ранее не идентифицированных в других исследованиях IBD — хромосом 2 и 3, для IBD и язвенный колит соответственно.

Идентифицируя определенные области афроамериканского генома, которые возникают отдельно от наследственного западноафриканского генома по сравнению с наследственным европейским геномом, которые несут ответственность за часть генетического риска ВЗК в афроамериканской популяции, исследователи нашли доказательства для регионов на четырех из 22 аутосомных (не связанных с полом) хромосом — 10, 15, 16 и 17 — как причины IBD. Каждый регион содержит десятки генов. Для каждого из этих регионов риск IBD, по-видимому, исходит от генома кавказских предков, который составляет 20 процентов афро-американского генома в целом, или, наоборот, от уникальных африканских защитных вариантов, как продемонстрировано в хромосомной области 17 в рамках иммунорегуляторных генов STAT3. и STAT5.

Поделится с друзьями

Добавить комментарий

Ваш e-mail не будет опубликован. Обязательные поля помечены *